Lançados originalmente para Game Boy Advance, os jogos da série Mega Man Zero contam os eventos que se passam a uma centena de anos após a subsérie X. Diante de uma distopia comandada pelo antigo herói X, uma pequena resistência de reploids marcados injustamente como mavericks revive o antigo herói Zero. Cabe agora ao jogador se esforçar para descobrir o que está acontecendo e encontrar uma forma de salvar esses robôs oprimidos.
Já ZX se passa dois séculos após Zero 4. Em um novo mundo pacífico, novos mavericks conhecidos como mechanilloids aparecem. Após uma série de eventos, cabe ao jogador encontrar os biometals (modelos robóticos baseados nos antigos heróis) e impedir os planos de um novo vilão.
Fonte: Capcom (Youtube oficial de Mega Man)