O jogo é descrito pela Koei Tecmo da seguinte forma:
Atelier Lulua: Scion of Arland convida os jogadores a assumirem o papel de Elmerulia "Lulua" Frixell, uma jovem aspirante a alquimista que treina sob a tutela da ex-aluna e agora mentora, Piana. Lulua estuda diligentemente para alcançar seu sonho de se tornar uma grande alquimista como sua mãe, Rorolina Frixell; mas durante seu treinamento Lulua descobre um misterioso Codex, despertando um antigo poder que permite a ela desencriptar uma única página - e muito mais mistérios para desvendar. Os jogadores terão que realizar as ações tradicionais do gameplay da série Atelier - coleta, batalha e síntese - para decifrar mais do texto e aprender novos tipos de alquimia.
Lulua viaja para Arland na esperança de melhorar suas habilidades e desvendar os mistérios do Codex. Chegando lá, ela descobre que o ateliê de sua mãe está sendo fechado. Com a ajuda do Codex, Lulua trabalha arduamente para salvar a loja antes que seja tarde demais. Esses são os primeiros passos dela em uma nova aventura recheada de diversão; mal sabe ela que Arland esconde mistérios que ainda não vieram à tona.
Na jornada, jogadores irão encontrar um elenco engajante de companheiros, com alguns rostos familiares na lista, incluindo: a alquimista mais renomada e mãe de Lulua, Rorolina Frixell; a ex-aprendiz de Rorona e alquimista influente, Totooria Helmond; a perspicaz aventura e guardiã de Totori, Mimi Houllier Von Schwarzlang; e o ex-cavaleiro e atual capitão da Guardian Force, Sterkenburg Cranach.
Fonte: Gematsu